题目

实时荧光定量pcr数据如何统计?
近日做实时荧光定量pcr,得到了不同的ct值,只是计算了△△ct以及2-△△ ct的值,但是我不知道如何使用spss进行统计分析,看到别人的文章都是均数±标准差的形式,我不知道如何这样统计.
例如我有 3个组,正常组,模型组,药物组,3个基因 tnf nf-kb 以及actin内参,重复3次,这样得到27个ct值,如何统计成x±s的方式呢?以及计算p值等.
（也可以站内联系）

提问时间：2020-10-30

答案

首先你这样做出来的统计没有意义.
应该是至少3次独立实验,而不是重复3次PCR.
如果3次试验,每次重复3次（取平均值算一次）.然后先定各个基因在对照组的值为一,再算出其他组该基因的相对量,比如内参CT值一样（都是15）,而TNF的CT值对照组是20,而模型组是19,则相对量是2 （对照组为1）.△△ct=（19-15）-（20-15）= -1,2-△△ ct= 2.
以此类推.
其实你只有3组,2个基因.用ANOVA先算,然后再用t test就可以了.结果表达为TNF：对照组1,模型组想x± d,药物组y± d.NF-kB:对照组1,模型组想x± d,药物组y± d.TNF和NF-kB间不需要比较.
请参考我发表的文章：
如果你提供email,我可以发全文给你.